| Judul | Analisa genetik gen glikoprotein D virus IBR strain los angeles dan hubungannya terhadap subfamily Alphaherpesvirinae: BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1 dan SuidHV-1 |
| Pengarang | Nur Khusni Hidayanto Ketut Karuni Nyanakumari Natih Ernes Andesfha Enuh Rahardjo Djusa |
| EDISI | Vol. 24, p. 1-13 |
| Penerbitan | Bogor BBPMSOH 2015 |
| Deskripsi Fisik | 2 ill., 5 tables ; 25 ref. (Summaries In, En) |
| ISBN | 0852-9612 |
| Subjek | Analytical methods -- PCR -- Bovine Herpesvirus -- Genes -- Nucleotide sequence -- Amino acid sequence -- Isolation technique |
| Catatan | Pengujian dengan menggunakan metode PCR dan sequencing telah dilakukan terhadap isolat IBR strain Los Angeles yang ditumbuhkan di sel MDBK dan analisis genetik dilakukan terhadap sequence reference BoHV-1.1, BoHV-1.2, BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1dan SuidHV-1. Hasil alignment nukleotida (nt) dan asam amino (aa) menunjukkan bahwa virus IBR strain Los Angeles memiliki persentase homologi nt dan aa tinggi terhadap BoHV-1.1 (nt:100%, aa:100%), BoHV-1.2 (nt: 98.2%, aa: 99.1%), BoHV-5 (nt:89.9%, aa: 97.7%), CerHV-1 (nt:90%, aa:97.8%), homologi aa terhadap CapHV-1 dan SuidHV-1 cukup tinggi yaitu 96.1% dan 93.7% tetapi homologi nt nya rendah yaitu 74.2% dan 50.4%. Hasil analisa pohon phylogenetic menunjukkan virus IBR strain Los Angeles termasuk dalam kelompok subtipe BoHV-1.1 namun masih meiliki satu sumber cabang yang sama dengan BoHV -1.2, sedangkan cabang yang terdekat lainnya yaitu BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1 namun untuk suidHV-1 memiliki jarak cabang terjauh dari kelompok virus BoHV-1.1. Hasil analis ini dapat menambah |
| Bentuk Karya | Tidak ada kode yang sesuai |
| Target Pembaca | Tidak ada kode yang sesuai |
| No Barcode | No. Panggil | Akses | Lokasi | Ketersediaan |
|---|
| Tag | Ind1 | Ind2 | Isi |
| 001 | INLIS000000000000012 | ||
| 005 | 20210323091238 | ||
| 008 | 210323||||||||| | ||| |||| || | | ||
| 020 | $a 0852-9612 | ||
| 035 | 0010-0321000012 | ||
| 041 | $a id | ||
| 100 | 0 | $a Nur Khusni Hidayanto | |
| 245 | 0 | 0 | $a Analisa genetik gen glikoprotein D virus IBR strain los angeles dan hubungannya terhadap subfamily Alphaherpesvirinae: BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1 dan SuidHV-1 |
| 250 | $a Vol. 24, p. 1-13 | ||
| 260 | $a Bogor $b BBPMSOH $c 2015 | ||
| 300 | $a 2 ill., 5 tables ; 25 ref. (Summaries In, En) | ||
| 500 | $a Pengujian dengan menggunakan metode PCR dan sequencing telah dilakukan terhadap isolat IBR strain Los Angeles yang ditumbuhkan di sel MDBK dan analisis genetik dilakukan terhadap sequence reference BoHV-1.1, BoHV-1.2, BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1dan SuidHV-1. Hasil alignment nukleotida (nt) dan asam amino (aa) menunjukkan bahwa virus IBR strain Los Angeles memiliki persentase homologi nt dan aa tinggi terhadap BoHV-1.1 (nt:100%, aa:100%), BoHV-1.2 (nt: 98.2%, aa: 99.1%), BoHV-5 (nt:89.9%, aa: 97.7%), CerHV-1 (nt:90%, aa:97.8%), homologi aa terhadap CapHV-1 dan SuidHV-1 cukup tinggi yaitu 96.1% dan 93.7% tetapi homologi nt nya rendah yaitu 74.2% dan 50.4%. Hasil analisa pohon phylogenetic menunjukkan virus IBR strain Los Angeles termasuk dalam kelompok subtipe BoHV-1.1 namun masih meiliki satu sumber cabang yang sama dengan BoHV -1.2, sedangkan cabang yang terdekat lainnya yaitu BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1 namun untuk suidHV-1 memiliki jarak cabang terjauh dari kelompok virus BoHV-1.1. Hasil analis ini dapat menambah informasi genetik yaitu indentitas, persentase homologi dan kestabilan genetik isolat challenge IBR strain Los Angeles yang digunakan di BBPMSOH. | ||
| 650 | 0 | $a Analytical methods -- PCR -- Bovine Herpesvirus -- Genes -- Nucleotide sequence -- Amino acid sequence -- Isolation technique | |
| 700 | 0 | $a Enuh Rahardjo Djusa | |
| 700 | 0 | $a Ernes Andesfha | |
| 700 | 0 | $a Ketut Karuni Nyanakumari Natih |
Content Unduh katalog
Karya Terkait :