| Judul | Identifikasi Molekular dinamika genetik virus Avian Influenza subtipe H5N1 clade 2.1.3 dan 2.3.2 |
| Pengarang | Hany Mucharini Ketut Karuni Nyanakumari Natih Ramlah Ernes Andesfha Enuh Rahardjo Djusa |
| EDISI | Vol. 20, p. 34-45 |
| Penerbitan | Bogor BBPMSOH 2013 |
| ISBN | 0852-9612 |
| Subjek | Animal Diseases -- Poultry -- PCR -- ISOLATION -- INDONESIA -- Avian Influenza Virus -- PHYLOGENY -- MOLECULAR GENETIC |
| Catatan | Avian Influenza (AI) subtipe H5N1 termasuk dalam kategori penyakit strategis di Indonesia yang menyebabkan kematian pada ayam, itik, puyuh dan manusia. Identifikasi molekular ini bertujuan untuk mengetahui dinamika genetik virus AI H5N1 sebagai salah satu langkah strategis dalam pencegahan, pengendalian dan pemberantasan penyakit AI. Metode identifikasi menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR) dan sequencing. Isolat virus berasal dari Balai Besar Veteriner (BBV) Wates. Analisis filogenetik tree menunjukkan isolat virus dari ayam yang merupakan hasil monitoring tahun 2011 termasuk dalam clade 2.1.3. Adapun isolat itik, entok dan puyuh yang diambil dari outbreak kematianmassal itik tahun 2012 termasuk dalam clade 2.3.2. Hasil analisis keragaman sekuen isolat clade 2.3.2 memiliki tingkat homologi yang tinggi yaitu 99,0%-99,5% terhadap virus reference clade 2.3.2 yang berasal dari Vietnam. Hasil keragaman sekuen antara isolat clade 2.1.3 dan isolat clade 2.3.2 memiliki tingkat keragaman yang rendah yaitu 90,4% |
| Bentuk Karya | Tidak ada kode yang sesuai |
| Target Pembaca | Tidak ada kode yang sesuai |
| No Barcode | No. Panggil | Akses | Lokasi | Ketersediaan |
|---|
| Tag | Ind1 | Ind2 | Isi |
| 001 | INLIS000000000000026 | ||
| 005 | 20210323091242 | ||
| 008 | 210323||||||||| | ||| |||| || | | ||
| 020 | $a 0852-9612 | ||
| 035 | 0010-0321000026 | ||
| 041 | $a id | ||
| 100 | 0 | $a Hany Mucharini | |
| 245 | 0 | 0 | $a Identifikasi Molekular dinamika genetik virus Avian Influenza subtipe H5N1 clade 2.1.3 dan 2.3.2 |
| 250 | $a Vol. 20, p. 34-45 | ||
| 260 | $a Bogor $b BBPMSOH $c 2013 | ||
| 500 | $a Avian Influenza (AI) subtipe H5N1 termasuk dalam kategori penyakit strategis di Indonesia yang menyebabkan kematian pada ayam, itik, puyuh dan manusia. Identifikasi molekular ini bertujuan untuk mengetahui dinamika genetik virus AI H5N1 sebagai salah satu langkah strategis dalam pencegahan, pengendalian dan pemberantasan penyakit AI. Metode identifikasi menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR) dan sequencing. Isolat virus berasal dari Balai Besar Veteriner (BBV) Wates. Analisis filogenetik tree menunjukkan isolat virus dari ayam yang merupakan hasil monitoring tahun 2011 termasuk dalam clade 2.1.3. Adapun isolat itik, entok dan puyuh yang diambil dari outbreak kematianmassal itik tahun 2012 termasuk dalam clade 2.3.2. Hasil analisis keragaman sekuen isolat clade 2.3.2 memiliki tingkat homologi yang tinggi yaitu 99,0%-99,5% terhadap virus reference clade 2.3.2 yang berasal dari Vietnam. Hasil keragaman sekuen antara isolat clade 2.1.3 dan isolat clade 2.3.2 memiliki tingkat keragaman yang rendah yaitu 90,4%-90,9%. Hal ini menunjukkan bahwa virus isolat dari itik ini termasuk virus H5N1 clade 2.3.2 yang merupakan varian baru di Indonesia. Hasil analisis asam amino pada daerah cleavage site, menunjukkan pola pengulangan asam amino arginin (R) dan lisin (K) yaitu PQRESRRKKR (isolat clade 2.1.3) dan PQRERRRKR (isolat clade 2.3.2) yang merupakan indikasi virus H5N1 strain High Pathogenic Avian Influenza (HPAI). Dua belas isolat virus tersebut memiliki pola asam amino yang sama pada receptor binding site (RBS) yaitu glutamin (Q)pada asam amino ke-222 dan glisin (G) pada asam amino ke-224. Hal ini berarti virus yang dianalisa masih mengenali avian reseptor (a 2-3) dan tidak mengalami perubahan pada pocket RBS. | ||
| 650 | 0 | $a Animal Diseases -- Poultry -- PCR -- ISOLATION -- INDONESIA -- Avian Influenza Virus -- PHYLOGENY -- MOLECULAR GENETIC | |
| 700 | 0 | $a Enuh Rahardjo Djusa | |
| 700 | 0 | $a Ernes Andesfha | |
| 700 | 0 | $a Ketut Karuni Nyanakumari Natih | |
| 700 | 0 | $a Ramlah |
Content Unduh katalog