Analisa genetik gen glikoprotein D virus IBR strain los angeles dan hubungannya terhadap subfamily Alphaherpesvirinae: BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1 dan SuidHV-1 Nur Khusni Hidayanto text Bogor BBPMSOH 2015 Vol. 24, p. 1-13 id 2 ill., 5 tables ; 25 ref. (Summaries In, En) Pengujian dengan menggunakan metode PCR dan sequencing telah dilakukan terhadap isolat IBR strain Los Angeles yang ditumbuhkan di sel MDBK dan analisis genetik dilakukan terhadap sequence reference BoHV-1.1, BoHV-1.2, BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1dan SuidHV-1. Hasil alignment nukleotida (nt) dan asam amino (aa) menunjukkan bahwa virus IBR strain Los Angeles memiliki persentase homologi nt dan aa tinggi terhadap BoHV-1.1 (nt:100%, aa:100%), BoHV-1.2 (nt: 98.2%, aa: 99.1%), BoHV-5 (nt:89.9%, aa: 97.7%), CerHV-1 (nt:90%, aa:97.8%), homologi aa terhadap CapHV-1 dan SuidHV-1 cukup tinggi yaitu 96.1% dan 93.7% tetapi homologi nt nya rendah yaitu 74.2% dan 50.4%. Hasil analisa pohon phylogenetic menunjukkan virus IBR strain Los Angeles termasuk dalam kelompok subtipe BoHV-1.1 namun masih meiliki satu sumber cabang yang sama dengan BoHV -1.2, sedangkan cabang yang terdekat lainnya yaitu BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1 namun untuk suidHV-1 memiliki jarak cabang terjauh dari kelompok virus BoHV-1.1. Hasil analis ini dapat menambah informasi genetik yaitu indentitas, persentase homologi dan kestabilan genetik isolat challenge IBR strain Los Angeles yang digunakan di BBPMSOH. Analytical methods -- PCR -- Bovine Herpesvirus -- Genes -- Nucleotide sequence -- Amino acid sequence -- Isolation technique 0852-9612 210323 20210323091238 INLIS000000000000012 Converted from MARCXML to MODS version 3.5 using MARC21slim2MODS3-5.xsl (Revision 1.106 2014/12/19)