02000 2200217 4500001002100000005001500021008004100036020001400077035001900091041000700110100002500117700003500142700001900177700002400196245016100220250002100381260002500402300005000427500117500477650013001652INLIS00000000000001220210323091238210323||||||||| | ||| |||| || |  a0852-9612 0010-0321000012 aid0 aNur Khusni Hidayanto0 aKetut Karuni Nyanakumari Natih0 aErnes Andesfha0 aEnuh Rahardjo Djusa00aAnalisa genetik gen glikoprotein D virus IBR strain los angeles dan hubungannya terhadap subfamily Alphaherpesvirinae: BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1 dan SuidHV-1 aVol. 24, p. 1-13 aBogorbBBPMSOHc2015 a2 ill., 5 tables ; 25 ref. (Summaries In, En) aPengujian dengan menggunakan metode PCR dan sequencing telah dilakukan terhadap isolat IBR strain Los Angeles yang ditumbuhkan di sel MDBK dan analisis genetik dilakukan terhadap sequence reference BoHV-1.1, BoHV-1.2, BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1dan SuidHV-1. Hasil alignment nukleotida (nt) dan asam amino (aa) menunjukkan bahwa virus IBR strain Los Angeles memiliki persentase homologi nt dan aa tinggi terhadap BoHV-1.1 (nt:100%, aa:100%), BoHV-1.2 (nt: 98.2%, aa: 99.1%), BoHV-5 (nt:89.9%, aa: 97.7%), CerHV-1 (nt:90%, aa:97.8%), homologi aa terhadap CapHV-1 dan SuidHV-1 cukup tinggi yaitu 96.1% dan 93.7% tetapi homologi nt nya rendah yaitu 74.2% dan 50.4%. Hasil analisa pohon phylogenetic menunjukkan virus IBR strain Los Angeles termasuk dalam kelompok subtipe BoHV-1.1 namun masih meiliki satu sumber cabang yang sama dengan BoHV -1.2, sedangkan cabang yang terdekat lainnya yaitu BoHV-5, CerHV-1, CapHV-1 namun untuk suidHV-1 memiliki jarak cabang terjauh dari kelompok virus BoHV-1.1. Hasil analis ini dapat menambah informasi genetik yaitu indentitas, persentase homologi dan kestabilan genetik isolat challenge IBR strain Los Angeles yang digunakan di BBPMSOH. 0aAnalytical methods -- PCR -- Bovine Herpesvirus -- Genes -- Nucleotide sequence -- Amino acid sequence -- Isolation technique